上级是否可以在系统给下属设定日志中的标签?

可以,有【工作日志管理】权限的人都可以给日志查看范围内的员工设置标签。
 
1、点击【工作日志】-【工作日志管理】,找到对应的日志提交人,点击查看工作日志;
 
2.点击工作手记下面的【标签】,选择你想设置的小标签,点击【确认】即可。